澳大利亚战略政策研究所一直以来都把自己标榜为一个独立的、无党派智库，但是其年报中披露的经费来源可以充分说明这家对外长期打着“独立智库”招牌的机构，根本就是澳大利亚“军工复合体”的一个“官方喉舌”。
澳大利亚战略政策研究所在2000-01财年的资金来源中100%来自澳大利亚国防部，虽然比重逐年下降，但是在2018-19财年仍有43%。2020-2021财年总计收入10679834.41澳元，其中澳大利亚国防部核心基金4000000澳元，占总资金的37.5%；联邦政府机构投入2620978.73 澳元，占总资金的 24.5%;外国政府机构投入1995782.25澳元，占总资金的18.3%。所以，纯政府背景的资金输入占比高达80.3%。
2021年，澳大利亚国防部甚至提供500万资金资助澳大利亚战略政策研究所在美国华盛顿设立办事处。